随着十年一遇的寒潮过去,气温一天天转暖,寒冷的冬天也随着这阵寒风渐渐过去,气温慢慢开始有了春天的气息。

亲爱的朋友们,你们是否渴望未来新一轮的科研工作呢? 趁着今年剩下的时间,让我们盘点一下过去一年来单菌领域好的研究成果,可以用来丰富新一年的研究计划~

下表是我们收集的15年单菌经典文献!

2015年单菌领域经典文献

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案例分析

案例1:北京型结核杆菌的进化史和全球传播

自然遗传学 doi:10.1038/ng.3195

作者利用来自99个国家的4987个结核分枝杆菌菌株的基因型数据,构建了菌株组合的进化树,并进一步研究了菌株的进化和传播历史。 其中,对有效种群规模的分析表明,工业革命、第一次世界大战和艾滋病毒流行导致了结核分枝杆菌的种群暴发,而20世纪60年代抗生素的兴起对该菌株起到了显着的抑制作用。

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图1 结核分枝杆菌菌株进化与地理位置的关系

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图2 结核分枝杆菌有效种群规模的演变

案例2:重组驱动的铜绿假单胞菌群体进化

科学报告 doi:10.1038/srep07649

肺纤维囊肿病是一种复杂的多微生物疾病,其中铜绿假单胞菌感染在发病机制中发挥着重要作用。 作者从同一患者体内分离出 44 株临床铜绿假单胞菌菌株,进行基因组测序和比较分析,并研究抗生素耐药性。 他们发现重组在抗生素抗性基因型的进化中发挥着重要作用。 。

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图3 铜绿假单胞菌系统发育树及关键基因与参考序列的相似性

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图4 菌株相对于参考基因组的重组变异位置信息

案例3:粟酒裂殖酵母重测序

自然遗传学 doi:10.1038/ng.3215

Schizosaccharomycesprombe是真核研究中重要的模式生物,但目前尚未对该菌株的进化史进行系统研究。 作者汇集了过去100年采集的161株野生裂解酵母,通过重测序,从多个角度挖掘了酵母的进化信息,特别是地理分布、驯化起源和表型相关性等方面。 取得了突破性成果。 进步。

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图5 真菌采样点分布(左)和基于变异位点的PCA分析(右)

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图6 真菌进化模型(左上)、采样时间与进化距离的关系(右上)以及可能的起源时间(下)

结论

一系列精彩案例都聚焦重要的科学问题,秉承严谨的科学思想,运用合适的工具,最终找到答案。 其中,微生物基因组测序分析提供了大量坚实的数据基础,在研究中发挥着重要作用。 如果您有好的材料和研究思路,诺禾致源可以为您提供优质的微生物测序服务,帮助您深入挖掘隐藏在基因组中的信息,找到您关心的问题的答案。

张周浩(微生物部)丨文案

贾红丽丨编辑

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